Мухомор издавна применяется в народной медицине, а также в гомеопатии в виде препарата Agaricus muscarius. В настоящее время мухомор не используется официальной медициной. Химический состав его изучен не до конца, хотя этим вопросом занимались ученые Швейцарии, Англии и Японии.По последним данным, гриб содержит сильно ядовитые алкалоиды: мускарин, мускаридин, мусцимол, иботеновую кислоту и оранжево-красный пигмент мускаруфин, обладающий антибиотическим и противоопухолевым действием. Мухомор популярен в народной медицине. Мазь из мухомора оказывает выраженное противовоспалительное и ранозаживляющее действие. Также используется наружно при болях в суставах и позвоночнике. Народы Чукотки, Камчатки, Аляски употребляли мухомор при нервных и психических расстройствах, для поднятия тонуса, снятия физической усталости. Лекари средней полосы России знали рецепты различных снадобий, содержащих мухоморы, которые использовали для лечения опухолей, заболеваний внутренних органов, туберкулеза, множественного склероза, функционального нарушения деятельности спинного мозга, ревматизма, подагры, а особенно — экземы и других поражений кожи. Многие из этих рецептов дошли и до наших дней. Мухомор обладает наркотическими и опьяняющими свойствами, благодаря которым стал воистину культовым грибом. По преданиям, в некоторых странах воины перед боем пили настой мухомора, который приводил их в агрессивное состояние и умножал мышечную силу. Таких воинов (их называли берсерками) одолеть в бою было невозможно. Настой мухомора употребляли так-же некоторые шаманы перед камланием — это приводило их в особое возбужденное состояние, сопровождающееся приливом психических и физических сил.